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class AminoAcid {
// Create a protein from three nucleotides.
constructor(n1, n2, n3) {
this.value = AminoAcid.codonMap[n1+n2+n3]
this._boundClickHandler = this.clickHandler.bind(this)
}
get elt() {
if (this._elt === undefined) {
this._elt = document.createElement('div')
this._elt.classList.add('amino-acid')
}
return this._elt
}
get value() {
return this.elt.innerText
}
set value(val) {
this.elt.innerText = val
}
lock() {
this.elt.removeEventListener('click', this._boundClickHandler)
}
unlock() {
this.elt.addEventListener('click', this._boundClickHandler)
}
get onClick() {
if (this._onClick !== undefined) {
return this._onClick
}
return () => {}
}
set onClick(fn) {
this._onClick = fn
}
clickHandler(evt) {
this.onClick(this)
}
}
AminoAcid.list = [
'Ala', 'Arg', 'Asn', 'Asp', 'Cys', 'Gln', 'Glu', 'Gly', 'His', 'Ile',
'Leu', 'Lys', 'Met', 'Phe', 'Pro', 'Ser', 'Thr', 'Trp', 'Tyr', 'Val',
'STOP'
]
AminoAcid.codonMap = {
'GCT': 'Ala', 'GCC': 'Ala', 'GCA': 'Ala', 'GCG': 'Ala',
'CGT': 'Arg', 'CGC': 'Arg', 'CGA': 'Arg', 'CGG': 'Arg', 'AGA': 'Arg', 'AGG': 'Arg',
'AAT': 'Asn', 'AAC': 'Asn',
'GAT': 'Asp', 'GAC': 'Asp',
'TGT': 'Cys', 'TGC': 'Cys',
'CAA': 'Gln', 'CAG': 'Gln',
'GAA': 'Glu', 'GAG': 'Glu',
'GGT': 'Gly', 'GGC': 'Gly', 'GGA': 'Gly', 'GGG': 'Gly',
'CAT': 'His', 'CAC': 'His',
'ATT': 'Ile', 'ATC': 'Ile', 'ATA': 'Ile',
'CTT': 'Leu', 'CTC': 'Leu', 'CTA': 'Leu', 'CTG': 'Leu', 'TTA': 'Leu', 'TTG': 'Leu',
'AAA': 'Lys', 'AAG': 'Lys',
'ATG': 'Met',
'TTT': 'Phe', 'TTC': 'Phe',
'CCT': 'Pro', 'CCC': 'Pro', 'CCA': 'Pro', 'CCG': 'Pro',
'TCT': 'Ser', 'TCC': 'Ser', 'TCA': 'Ser', 'TCG': 'Ser', 'AGT': 'Ser', 'AGC': 'Ser',
'ACT': 'Thr', 'ACC': 'Thr', 'ACA': 'Thr', 'ACG': 'Thr',
'TGG': 'Trp',
'TAT': 'Tyr', 'TAC': 'Tyr',
'GTT': 'Val', 'GTC': 'Val', 'GTA': 'Val', 'GTG': 'Val',
'TAA': 'STOP', 'TGA': 'STOP', 'TAG': 'STOP',
}
export default AminoAcid
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